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빅데이터
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1. 빅데이터란?
빅데이터 분석은 대량의 데이터에서 유의미한 정보를 추출하는 과정입니다. 이는 생어 시퀀싱과 차세대 염기서열 분석(NGS) 등의 방법을 활용하여 진행됩니다. 이 분석을 통해 농업, 축산, 환경 등 다양한 분야에서 유익한 통찰을 얻을 수 있습니다.
2. NGS 염기서열을 기반으로 한 빅데이터 분석
빅데이터 분석
NGS
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1. 염기서열 분석의 중요성
우리가 흔히 알고 있는 유전자는 DNA (Deoxyribonucleic acid)라 불리며, 생명체의 유전정보를 담고 있는 유전물질로 알려져 있습니다.
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이러한 DNA는 아데닌(Adenine), 구아닌(Guanine), 시토신(Cytosine), 및 티민(Thymine) 4개의 염기로 구성되어 있고 생명체의 종류에 따라 그 크기가 다릅니다.
2. 생어 시퀀싱(Sanger sequencing)
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DNA 염기서열 분석을 위한 최초의 방법은 1977년 Frederic Sanger라는 과학자에 의해 개발된 사슬 종결법이라는 기술인데 기술 발명자의 이름을 따 생어 시퀀싱이라 부릅니다.
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이 기술은 형광 표지 혹은 방사선 표지가 된 유전자 구성물질(dNTP)을 활용하여 염기서열을 읽어냅니다. 기술 초반에는 방사선동위원소를 활용했으나, 최근엔 형광 표지를 활용하여 염기서열을 분석합니다.
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생어 시퀀싱의 장점으로는 정확성이 뛰어나 현재도 많이 사용됩니다. 하지만, 1회 운용에 많은 비용이 발생하며 비용 대비 적은 output을 생산합니다. 따라서, 최근에는 차세대 염기서열 분석 (Next generation sequencing)을 활용합니다.
3. 차세대 염기서열 분석(Next Generation Sequencing)
1) NGS의 도입
NGS란?
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